Засновано монастир у 1060 р. князем Святославом Ярославичем на місці, де за легендою на одній з ялин він побачив ікону Божої Матері.
Архітектурний ансамбль Єлецького монастиря розташовано на підвищеному правому березі річки Десна, між давнім чернігівським дитинцем (територія сучасного Валу) і Троїцько-Іллінським монастирем. Разом з пам’ятками архітектури, які там збереглися, він утворює історичну панораму міста.
Згідно з переказами у монастирі деякий час перебував «батько руського чернецтва» Антоній Печерський. Належить до комплексу пам’яток НАІЗ «Чернігів стародавній». Нині – діючий православний монастир.