Вважається, що вона утворилася приблизно 20 мільйонів років тому через вплив підземних вод.
Печера має унікальний клімат. Вологість там досить висока, майже 95 %, а температура постійно тримається на рівні 10–12 °C. Повітря в печері має підвищену іонізацію й характеризується майже повною відсутністю бактерій. Стіни печери вкриті кристалами білого й різних відтінків рожевого та коричневого кольору. Звідси, власне, і назва. Завдяки грі світла та впливу природи ці кристали утворюють найхимерніші фігури.
Перша письмова згадка про печеру була ще в 1721 році. А її дослідження проводилися в 19 і 20 століттях, що робить Кришталеву найбільш вивченою печерою в Європі. Уже в 60–70-х роках минулого століття зробили мапу її тунелів.
Загальна досліджена довжина коридорів і залів, з яких складається печера, становить 23 кілометри. Туристичний маршрут майже вдесятеро коротший і складає 2,5 кілометри. Він досить легкий і не потребує додаткових навичок для проходження. Тут сухо і скрізь є ліхтарі. До речі, Кришталева — єдина освітлена печера на заході України, що приймає туристів цілорічно.
З чудернацькими формами кристалів пов’язані й казкові назви, що трапляються на маршруті: грот Кам’яних Сліз, зал Буйвола, лабіринт Кам’яних Квітів, зали Завалів, Втрачених сподівань тощо.
