У його фондах понад 50 тисяч експонатів, пов’язаних із природою та історією Маріуполя і Приазов’я. Експозиція представлена в 7 залах і розділена на 4 частини:
- відділ природи — демонструє останки стародавніх тварин, корисні копалини та мінерали, серед яких камінь названий на честь міста, — маріуполіт; гербарії з місцевих рослин, опудала тварин, фотографії та діорами;
- історія дорадянського періоду — тут представлені предмети побуту, знаряддя праці від часів перших поселень на території, епохи енеоліту, доби бронзи та заліза, кочових племен Середньовіччя, періоду створення Маріуполя в 1778 році. В іншому залі демонструються документи, фотографії, речі, що пов’язані з життям місцевого населення в другій половині 19 століття до лютневої революції 1917 року;
- історія радянського періоду — відділ присвячений життю краю з 1917 по 1991 роки;
- відділ історії сучасної України — з артефактами, пов’язаними з розвитком міста в часи незалежності.
Крім виставкових залів, музей має наукову бібліотеку з 17 тисячами книг, колекцію монет та живопису.
Філіями Маріупольського краєзнавчого музею є:
- Музей народного побуту;
- Виставковий зал імені А. І. Куїнджі;
- Музей історії греків Приазов'я;
- Художній музей імені Куїнджі.
