95 % території парку займають ліси. Вони є неймовірно унікальними за наповненням адже НПП «Вижницький» лежить на межі гео-ботанічних та флористичних районів. Місцеву флору формують близько 960 видів рослин, з них 40 червонокнижних та багато реліктових. «Вижницький» парк є єдиним місцем в Карпатах, де росте дика орхідея та усі 3 види папороті з роду багаторядників.
62 види з місцевої фауни є червонокнижними і 11 занесені до Червоного списку Європи.
Частиною парку є також ландшафтні заказники загальнодержавного значення «Стебник» та «Лужки», заповідні урочища «Стаєчний» та «Яворів».