В 2011 году музею присвоено звание «Образцовый музей» в соответствии с приказом Министерства образования и науки, молодежи и спорта Украины.
Это признание является заслугой всех поколений музейщиков, которые работали от начала возрождения Острожской академии.
Становление Центра изучения наследия Острожской академии происходило в неразрывной связи с процессом возрождения Острожской академии, новый этап истории которой начался 12 апреля 1994 после Указа Президента Леонида Кравчука "Об образовании Острожского коллегиума". С целью популяризации славной истории острожского культурно-просветительского центра и прошлого заведений, в стенах которых разместился возрожден университет, было решено создать Центр изучения наследия Острожской академии. Его возглавил П. С. Андрухов, однако, развернуть активную деятельность историку помешала внезапная смерть в августе 1996 г. С этого же года директором Центра и фактически создателем музея истории Острожской академии стала Ярослава Витальевна Бондарчук. Человек незаурядных знаний, с большим опытом музейной работы. Именно благодаря ее упорному труду, в Острожской академии был создан музей в составе Центра изучения наследия Острожской академии. Первий экспозиционний зал был посвящен истории Острожской академии XVI-го века и постепенно наполнялся экспонатами из деятельности возрожденной академии.
С каждым годом экспозиционные помещения музея расширялись, увеличивалось количество экспонатов. Феномен возрождения и быстрого развития Острожской академии заинтересовал общественность. В акамдемию все чаще стали приезжать высокопоставленные гости. Посетители музеев Острога с большим интересом приходили и в музей Острожской академии. Итак, музей сразу же после создания начал проводить экскурсионную деятельность, продолжая и научно-исследовательскую и фондовой работу. Таким образом, созданию музея предшествовала упорная работа сотрудников Центра изучения наследия Острожской академии.
