История собора начинается 31 августа 1640 года, когда дарственной грамотой графа Ивана Другета ордену иезуитов были предоставлены земли в Ужгороде. Когда строительство было почти завершено, началась война между Трансильванией и Австрией, в результате чего часть зданий были повреждены. Однако уже в 1646 году храм был освящен. В 1775 году, вскоре после роспуска ордена иезуитов, храм был передан Мукачевской греко-католической епархии.
XIX век в истории храма отметился значительным изменением интерьера: был перестроен иконостас, расписаны стены и потолок, нанесены мраморные арабески. На входе достроили портик и колонны. Именно в таком, обновленном виде, храм сохранился до наших дней. Со времен иезуитов сохранились лишь боковые алтари центральных часовен с образами "Коронация Марии" и "Богородица с Младенцем и предстоящими учеником".
Приход советской власти ознаменовался тем, что храм передали православной общине. Лишь в 1991 году он снова стал греко-католической церковью. Сегодня в храме проводят богослужения.
