У 1728 році німець Йоганн Гейтер відкрив на Подолі неподалік від Андріївського узвозу першу в Києві приватну аптеку, патент на яку він отримав за указом імператора Петра ІІ. Аптека проіснувала близько 110 років, до 1835 року, після чого будинок був проданий і переходив з рук в руки. У 1983 році в цьому приміщенні почалася реставрація і створення аптеки-музею, відкриття якої відбулося в 1986 році.
Колекція музею налічує більш ніж 50 тисяч експонатів – аптечні меблі XVIII – XIX ст., зразки аптечного посуду різних епох, фрагменти рукописів часів Київської Русі, російської, польської фармакопеї XIX – XX ст., підручники з медицини, та терапії тих часів, рецептурні журнали, особисті архівні матеріали київських аптекарів. У підземеллі розміщено експозицію, що розповідає про історію медицини та фармації: зала-печера, християнська зала, хата знахарки, винний погріб, лабораторія алхіміка.
