У музеї зберігається напрестольне Євангеліє у срібному з позолотою окладі – подарунок Петра Першого Ізюмському Преображенському собору, видання 1707 року; прекрасна колекція нумізматики, в якій багато рідкісних монет; археологічна колекція; живописні твори і багато інших раритетних речей.
У музеї зберігаються матеріали з історії краю в
різні його періоди – від давньоруської держави і заселення земель у XVII ст. до сьогодення. Серед експонатів – напрестольне Євангеліє Петра I, нумізматична та археологічна колекції, документи з історії Ізюмського слобідського козачого полку.