В 1900 году Николай Васильевич окончательно поселился в имении "Отрада" в селе Яковцы, которое сейчас является частью Полтавы. Имение досталось семье от родственников жены Склифосовского. Здесь был сад, который называли "Полтавской Швейцарией" и одна из первых пивоварен.
Здесь, на Полтавщине, выдающийся врач умер от инсульта в возрасте 68 лет. Очевидно, что его здоровье было подкошенный многочисленными трагическими событиями в семейной жизни. Первая жена врача умерла в 24 года. Почти все из семерых детей погибли в достаточно молодом возрасте. В частности, сын Владимир покончил жизнь самоубийством. По другим сведениям — умер от туберкулеза, как и его брат Константин. Именно могилу Владимира можно увидеть рядом с могилой отца.
После смерти Склифосовского оставались живыми вторая жена София и дочь Тамара. Однако женщин жестоко убили большевики в 1919 году. Их не спасла даже бумага, подписанная Лениным, которая удостоверяла факт, что на семью Склифосовского репрессии не распространяются. Изуродованные тела женщин несколько дней не позволяли похоронить. До сих пор неизвестно, где находятся их могилы.
