Історія цього місця почалася в XVIII ст., коли Петро Могила побудував тут храм на честь Іоанна Нового (Сочавського) і заснував заміський скит Лаври. Пустинь стала літньою резиденцією Київських Митрополитів.
У 1845 р. свт. Філарет (Амфітеатров) побудував кам'яний храм з двома прибудовами: Трьох Святителів і Іоанна Сочавського. У 1910-1912 рр. був побудований храм на честь ікони Божої Матері «Живоносне Джерело». Крім храмів, в Голосієво знаходилися: літній будинок Митрополитів з домовим храмом прп. Іоанна Багатостраждального, готель, головний госп. двір Лаври й ін. споруди.
Пустинь знищила радянська влада в 1926 р. коли були зруйновані всі храми. У 1993 р. обитель відновили як скит Лаври. У тому ж році були здобуті мощі прп. Алексія Голосіївського, Київського. Відкрито храм Іоанна Багатостраждального.
В усипальниці під храмом Божої Матері з 2006 р. зберігаються мощі матінки Аліпії. Блаженна стариця мала за життя дар зцілення, і навіть після своєї смерті вона допомагає хворим.
