Экспозиции музея размещены в оборонительных сооружениях XIX в.
Несут информацию об истории украинской и киевской фортификации со времен трипольской культуры до наших дней и истории использования киевской крепости, в частности под гауптвахту. Экспозиция содержит уникальные экспонаты археологических раскопок трипольской культуры, макеты укреплений Киевской крепости, оружие, доспехи и предметы быта, военно-историческую миниатюру, уникальные печати дивизии имени батьки Махно и УНР.